Agencija se finansira iz budžeta koji se sastoji od sredstava iz državnog budžeta i nezavisnih izvora u skladu sa Zakonom o izvršenju budžetu institucija Bosne i Hercegovine i međunarodnih obaveza Bosne i Hercegovine.
čl. 15. Zakona o agenciji za unapređenje stranih investicija u Bosni i Hercegovini, „Sl. glasnik BiH" br. 56/04