Upravni odbor Agencije sastoji se od devet članova. Članovi Upravnog odbora imenuju se na period od dvije godine. Imenovanje članova Upravnog odbora vrši se kako slijedi: a) dva člana imenuje Vijeće ministara BiH; b) po jednog člana imenuje Vlada Federacije BiH i Vlada Republike Srpske; c) jednog člana imenuje Vanjskotrgovinska komora BiH; d) dva člana predstavljaju poslovnu zajednicu u Bosni i Hercegovini, na način da po jednog člana imenuje Asocijacija poslodavaca u Federaciji BiH i Savez poslodavaca Republike Srpske; e) dva člana predstavljaju zajednicu stranih investitora u Bosni i Hercegovini, a imenuju se od Udruženja stranih investitora u Bosni i Hercegovini.
čl. 9. Zakona o agenciji za unapređenje stranih investicija u Bosni i Hercegovini, „Sl. glasnik BiH" br. 56/04