Ministarstvo odbrane nadležno je za: - stvaranje i održavanje odbrambenog kapaciteta kako bi se osigurala zaštita suvereniteta, teritorijalnog integriteta, političke nezavisnosti i međunarodnog subjektiviteta Bosne i Hercegovine; - predlaganje budžeta za odbranu Bosne i Hercegovine i izdavanje odobrenja za rashode iz budžeta Bosne i Hercegovine za odbranu; - organizaciju, opremanje i snabdijevanje Oružanih snaga; - reguliranje organizacije i vođenja pukova, njihovih komandi i osoblja; - provođenje definiranih politika i smjernica, te osiguranje provođenja zakona, ostalih propisa i općih akata iz oblasti odbrane; - izvršavanje obaveza u vezi sa izgradnjom i održavanjem vojnih i drugih objekata, kao i objekata od posebnog značaja za odbranu Bosne i Hercegovine; - upravljanje i korištenje sredstava namijenjenih za potrebe Oružanih snaga; - nabavljanje, čuvanje i obnavljanje rezervnih proizvoda posebne namjene za potrebe Oružanih snaga; - izrađivanje kriterija o uslovima i načinu skladištenja, čuvanja i održavanja naoružanja i vojne opreme i brigu o zaštiti materijalnih sredstava i objekata u Oružanim snagama; - ispitivanje, kontrolu kvaliteta i verifikaciju naoružanja i vojne opreme za potrebe Oružanih snaga; - planiranje, izvođenje geodetskih, fotogrametrijskih i kartografsko-reprodukcijskih poslova od interesa za odbranu, provođenje nadzora nad izvođenjem tih poslova i brigu o čuvanju, skladištenju i distribuciji geodetskih, fotogrametrijskih i kartografskih materijala i dokumenata značajnih za odbranu; - organiziranje veze, protuelektronskog osiguranja i kriptozaštite Oružanih snaga; - organiziranje i obavljanje inspekcijskog nadzora nad Oružanim snagama; - organiziranje i provođenje mjera sigurnosti i zaštite odbrambenog sistema, kao i tajnih podataka odbrane; - donošenje politika i osnovnih pravila za Oružane snage; - donošenje propisa o školovanju, odgoju i obrazovanju u Oružanim snagama; - donošenje propisa o vojnoj disciplini i drugih propisa predviđenih ovim zakonom; - predstavljanje Bosne i Hercegovine u međunarodnim odnosima koji se tiču pitanja odbrane; - nadzor nad svim subjektima Oružanih snaga; - upućivanje prijedloga Vijeću ministara Bosne i Hercegovine sa inicijativom o učešću u operacijama podrške miru kao i druge nadležnosti propisane Zakonom o učešću pripadnika Oružanih snaga Bosne i Hercegovine, policijskih službenika, državnih službenika i ostalih zaposlenika u operacijama podrške miru i drugim aktivnostima u inozemstvu ("Službeni glasnik BiH", broj 14/05); - izradu, pregled i ažuriranje Odbrambene politike Bosne i Hercegovine koju odobrava Predsjedništvo; - izradu i odobravanje politika i propisa u pogledu organizacije, administracije, osoblja, obuke, opremanja i upotrebe Oružanih snaga; - osiguravanje da Bosna i Hercegovina poštuje međunarodne obaveze koje se tiču pitanja odbrane; - izradu procedura za odobravanje vojne pomoći civilnim vlastima u slučaju prirodnih i drugih katastrofa i nesreća, prema ovlaštenjima Predsjedništva; - osiguravanje transparentnosti funkcija Ministarstva odbrane; - utvrđivanje politike stambenog zbrinjavanja pripadnika Ministarstva odbrane i Oružanih snaga; - planiranje i organiziranje naučnoistraživačkog rada značajnog za odbranu; - davanje stručnih mišljenja o nastavnim programima koji se tiču isključivo vojnih aspekata civilne odbrane, a na zahtjev nadležnih institucija; - ostale nadležnosti definirane u zakonu.
čl. 15a. Zakona o ministarstvima i drugim organima uprave BiH, „Sl. glasnik BiH" br. 5/03, 42/03, 26/04, 42/04, 45/06, 88/07, 35/09, 59/09, 103/09, 87/12, 6/13, 19/16 i 83/17 (prečišćeni tekst — neslužbeno)