Dužnosti Uprava je jedini organ u Bosni i Hercegovini koji je nadležan za provođenje zakonskih propisa o indirektnom oporezivanju i politike, koju utvrdi Vijeće ministara na prijedlog Odbora, kao i za naplatu i raspodjelu indirektnih poreza na teritoriji Bosne i Hercegovine. Uprava je nadležna za sva druga pitanja koja joj mogu biti povjerena zakonom.
čl. 4. Zakona o sistemu indirektnog oporezivanja u Bosni i Hercegovini, „Sl. glasnik BiH" br. 44/03