Obavezna dokumentacija je: – certifikati od veleprometnika o izvršenim ispitivanjima supstanci za galenske i magistralne lijekove u apoteci, – knjiga evidencije o prijemu i izdavanju opojnih droga, – knjiga prometa otrova, – protokol laboratorijskog rada, – evidencija o magistralnim lijekovima koji se pripremaju od ljekovitih supstanci jakog i vrlo jakog djelovanja, – evidencija o nabavkama i o potrošnji lijekova. Izuzetno od stava 1. ovog člana, u depou apoteke se vodi samo evidencija o potrošnji lijekova. Način praćenja potrošnje lijekova bliže se uređuje propisom federalnog ministra.
čl. 50. Zakona o apotekarskoj djelatnosti, „Sl. novine FBiH" br. 40/10