Agencija je samostalna i neprofitna organizacija.Agencija ima ovlasti za sklapanje ugovora, nabavku pokretne i nepokretne imovine za vlastite potrebe u skladu sa Zakonom i finansijskim planom Agencije.
čl. 3. Zakona o finansijsko-informatičkoj agenciji, „Sl. novine FBiH" br. 80/11