Komisija može propisati pravila koja je Registar obavezan primjenjivati, a koja se odnose na: vođenje evidencija, kapital, garancije poravnanja, distribuciju dividende, internu kontrolu, obaveze obavještavanja Komisije i javnosti, nadzor od Komisije, postupanje po žalbama na rad Registra i druga pitanja koja se odnose na rad i obavljanje poslova Registra.
čl. 12c. Zakona o registru vrijednosnih papira, „Sl. novine FBiH" br. 33/04