Upravni odbor agencije za vode (1) Agencijom za vode upravlja upravni odbor. (2) Upravni odbor broji pet članova. Predsjednika i članove upravnog odbora imenuje i razrješava Vlada Federacije na prijedlog Federalnog ministarstva, a na osnovu provedenog javnog konkursa, u skladu sa zakonom. (3) Članovi upravnog odbora biraju se iz reda stručnjaka sa područja upravljanja vodama, javnih finansija i drugih oblasti, s tim da se jedan član upravnog odbora imenuje iz reda zaposlenika agencije za vode i jedan član iz Federalnog ministarstva. (4) Upravni odbor imenuje se na period od četiri godine. Za člana upravnog odbora može se imenovati jedno lice najviše u dva mandata. (5) Predsjednik Upravnog odbora ne može biti iz istog konstitutivnog naroda kao i direktor Agencije za vode.
čl. 159. Zakona o vodama, „Sl. novine FBiH" br. 70/06