Zaštita prirode provodi se očuvanjem biološke i pejzažne raznolikosti, te zaštitom prirodnih vrijednosti. Zaštita prirode provodi se naročito: - utvrđivanjem svih dijelova biološke i pejzažne raznolikosti i njihove ugroženosti; - provođenjem mjera zaštite prirode; - unošenjem utvrđenih uslova i utvrđivanje mjera zaštite prirode u dokumente prostornog uređenja i sektorske strategije i planovi upravljanja, uz izradu strateške procjene uticaja na okoliš (SEA), kao i upravljanja prirodnim dobrima u djelatnostima rudarstva, energetike, prometa i komunikacija, poljoprivrede, šumarstva, lovstva, ribarstva, vodnih dobara te drugim djelatnostima; - utvrđivanje uvjeta i mjera zaštite svih vrsta ptica uvođenjem monitoringa, te identifikacija "IBA" područja od posebnog značaja za uspostavljanje mreže zaštićenih područja označenih kao NATURA 2000.; - izradom izvještaja o stanju prirode, kao dijela integralnog izvještaja o stanju okoliša, donošenjem i provođenjem strategija, programa, akcionih planova, planova upravljanja, uslova i mjera zaštite prirode; - praćenjem stanja prirode te obavještavanjem javnosti o stanju prirode, i sudjelovanjem javnosti u zaštiti prirode; - provođenjem postupaka ocjene prihvatljivosti zahvata za prirodu i procjene utjecaja na okoliš u skladu sa Zakonom o zaštiti okoliša Federacije BiH i njegovim provedbenim propisima; - podsticanjem i promocijom zaštite prirode, te razvijanjem svijesti o potrebi zaštite prirode u odgoju i obrazovanju; - utvrđivanjem prirodnih vrijednosti i zaštićenih prirodnih vrijednosti; - uspostavom sistema upravljanja prirodnim vrijednostima i zaštićenim prirodnim vrijednostima; - povezivanjem i usklađivanjem sistema zaštite prirode s međunarodnim sistemom zaštite prirode; - podsticanjem naučnog i stručnog rada u području zaštite prirode; - osiguranjem finansijskih sredstava za provođenje zaštite prirode.
čl. 6. Zakona o zaštiti prirode, „Sl. novine FBiH" br. 66/13