Zavod sportske medicine obavlja sljedeće poslove: - planira, predlaže i provodi mjere za očuvanje i unapređenje zdravlja sportista i učesnika u sportskoj rekreaciji, - provodi preventivnu zdravstvenu zaštitu svih registriranih sportista putem kontrolnih, periodičnih i sistematskih specijalističkih ljekarskih pregleda, - specijalističku kurativnu zdravstvenu zaštitu, liječenje i rehabilitaciju oboljelih i povrijeđenih sportista, - izrađuje i predlaže doktrinu, standarde i metode rada u zdravstvenom odabiru i praćenju zdravstvenog stanja sportista po pojedinim sportskim granama na području kantona za koji se osniva, - vodi registar specifičnih oboljenja i povreda u sportu, - vodi naučno-istraživački rad iz oblasti sportske medicine, - vrši edukaciju medicinskih kadrova iz sportske medicine, - vrši ocjenu stanja zdravlja i daje saglasnost za aktivno bavljenje sportom i sportskom rekreacijom, - prati vrhunska dostignuća sportista kroz specifična testiranja i učestvuje u pripremanju sportista za velika sportska takmičenja (svjetska prvenstva, olimpijske i mediteranske igre), - sarađuje sa zdravstvenim ustanovama svih nivoa zdravstvene zaštite, - vrši međusobno stručno i funkcionalno povezivanje i usklađuje primjenu jedinstvene metodologije rada. Zavod sportske medicine i jedinice sportske medicine ostvaruju prihode putem ugovornih obaveza o pružanju programa mjera specifične zdravstvene zaštite sportista sa sportskim organizacijama, ustanovama i drugim pravnim licima.
čl. 126. Zakona o zdravstvenoj zaštiti fbih, „Sl. novine FBiH" br. 46/10 (prečišćeni tekst — neslužbeno)