Upravni i stručni nadzor nad radom Muzeja vrši Ministarstvo. Stručni nadzor nad radom muzeja jedinica lokalne samouprave i uprave vrši Muzej Sarajeva. Nadzor nad provođenjem ovog zakona i propisa donesenih za njegovo provođenje vrši Ministarstvo. Inspekcijski nadzor nad provođenjem ovog zakona vrši nadležna inspekcija za zaštitu dobara baštine.
čl. 44. Zakona o muzejskoj djelatnosti, „Sl. novine KS" br. 13/17