Naučnoistraživačka djelatnost zasniva se na principu povezanosti osnovnih, primijenjenih i razvojnih istraživanja. Naučnoistraživačka djelatnost u Kantonu zasniva se na sljedećim principima: a) slobodi i autonomiji stvaralaštva; b) konkurentnosti naučnih programa i projekata; c) primjeni međunarodnih standarda i međunarodnih mjerila kvaliteta u oblasti nauke; d) decentraliziranom uređenju i policentričnom organiziranju u oblasti nauke; e) javnosti rada i rezultata tog rada koji su podložni naučnoj i stručnoj kritici; f) etičnosti naučnoistraživačkog osoblja; g) saradnji s domaćim i međunarodnim institucijama u oblasti nauke i istraživanja; h) povezanosti sa sistemom visokog obrazovanja i odgojno-obrazovnim ustanovama na svim nivoima; i) zaštiti intelektualnog vlasništva, ljudskih prava, te lične i opće sigurnosti; j) brizi za održiv razvoj i zaštitu okoliša; k) potrebama privrednog i društvenog razvoja; l) poticanju i uvažavanju specifičnih sadržaja od značaja za Kanton i BiH.
čl. 4. Zakona o naučnoistraživačkoj djelatnosti, „Sl. novine KS" br. 26/16