Direktor rukovodi radom Agencije, predstavlja i zastupa Agenciju i odgovoran je za zakonitost njenog rada. Direktora Agencije imenuje i razrješava Vlada na period od četiri godine, uz prethodno proveden postupak javne konkurencije. Uvjeti za imenovanje i razrješenje direktora utvrđuju se Statutom Agencije.
čl. 9. Zakona o mirnom rješavanju radnih sporova, „Sl. glasnik RS" br. 91/16