Direktora i zamjenika direktora Agencije imenuje Vijeće ministara Bosne i Hercegovine (u daljem tekstu: Vijeće ministara), na prijedlog predsjedavajućeg Vijeća ministara u skladu sa Zakonom o državnoj službi u institucijama Bosne i Hercegovine. Direktora i zamjenika direktora imenuje Vijeće ministara na period od četiri godine, s tim da na istu funkciju mogu biti imenovani još jedan mandat. Sekretar Agencije bira se u skladu sa Zakonom o državnoj službi institucija Bosne i Hercegovine.
čl. 7. Zakona o agenciji za unapređenje stranih investicija u Bosni i Hercegovini, „Sl. glasnik BiH" br. 56/04