Direktor Agencije u okviru svojih prava i obaveza obavlja sljedeće poslove: - predlaže Odboru sve opće akte, pravila, uputstva što odobrava i donosi Odbor, - zastupa Agenciju u odnosima sa klijentima i svim drugim institucijama, - provodi politike i odluke Odbora, - obavlja i druge aktivnosti u skladu sa Statutom Agencije.Zamjenik direktora Agencije može ispred direktora obavljati aktivnosti iz stava 1. ovog člana na osnovu pisanog ovlaštenja direktora i u slučaju kada direktor odsustvuje sa posla u skladu sa zakonom.
čl. 12. Zakona o finansijsko-informatičkoj agenciji, „Sl. novine FBiH" br. 80/11